Музей «Юнги Северного флота» создан в лицее почти 30 лет назад.  В 2014 году музей был  реконструирован. Проделана большая работа по воссозданию экспозиций, проведению инвентарного учета. 

       Основной задачей музея является патриотическое воспитание учащихся. В музее регулярно проводятся экскурсии для лицеистов и гостей. В роли экскурсоводов выступают учащиеся лицея. В 2014-2015 учебном году 7 лицеистов стали призёрами районных и городских конкурсов экскурсоводов.

       В музее лицея учащиеся делают первые шаги в научной работе, с которыми ребята выступают и побеждают на городских и районных конференциях таких как «Лениград. Война. Блокада», «Морской венок Славы».

       Идёт систематическое пополнение экспонатов музея, расширение социальных связей музея и партнёрства на уровне Санкт-Петербурга и Российской Федерации.

      Музей имеет официальный паспорт, выданный Комитетом по образованию СПб.

      Учитывая значимость проводимой в музее работы, нам было предложено (первому из школьных музеев) вступить в Ассоциацию военно-морских музеев России.

       В феврале 2016 г состоялась Коллегия Ассоциации. Музею был вручен сертификат о членстве в Ассоциации. По поручению президента Ассоциации руководитель музея Е.С. Корюкаев поделился опытом работы школьных музеев военно-морской направленности Санкт-Петербурга, а всего в нашем городе их 14.  По инициативе Е.С. Корюкаева Коллегия приняла решение о создании секции школьных музеев военно-морской направленности при Ассоциации России. В перспективе планируется объединение школьных музеев морской направленности по всей России. Руководство секцией поручено осуществлять  руководителю нашего музея, который был избран одним из вице-президентов Ассоциации.

В рамках секции планируется  проводить мастер-классы для педагогов и учащихся, совместные мероприятия по обмену опытом работы, будет осуществляться информационный обмен.